中国水产科学研究院东海水产研究所创建于1958年10月，是我国面向东海和远洋的国家综合性渔业研究机构，现隶属于农业部中国水产科学研究院，为国家非营利性科研机构（中央级公益性科研院所）。东海水产研究所位于上海市杨浦区军工路300号，占地面积22156平方米，建筑面积20462平方米，拥有各类办公及科研用房10幢；截止2012年底，全所固定资产总额达1.65亿元，共有各类科学仪器设备2302台（套），总价值达到1.11亿元。 研究所以国家渔业发展需求为首要任务，根据学科优势和自身发展目标，主要开展资源保护及利用、捕捞与渔业工程、远洋与极地渔业资源开发、生态环境评价与保护、遗传育种与生物技术、水产养殖技术、水产品加工与质量安全、渔业信息与战略等研究。 全所在职职工编制人数450人，在编人员284人，其中科研人员225名，包括研究员30名，副研63名；国家新世纪百千万人才工程国家级人选2人、享有国务院政府特殊津贴的专家29人、农业部有突出贡献的中青年专家5人、中国水产科学研究院首席科学家4人、上海市领军人才3人。研究所已与上海海洋大学、华东师范大学、中国海洋大学、中国科学院海洋研究所、大连海洋大学建立联合招收培养研究生机制，2012年，研究所在培研究生100余名。研究所拥有一支学科结构合理、业务素质较高，具有雄厚实力的渔业科研队伍。 2003年，研究所进入国家科技创新体系（国家非营利性科研机构）；2005年，通过了中国质量体系认证中心ISO9001：2000质量管理体系认证，取得了包括海洋水产科研项目（设计、开发）、科技成果转化的质量管理系统认证证书，成为我国渔业科研系统第一个进入ISO9001质量管理体系的单位；2006年，经中华人民共和国人事部和全国博士后管理委员会批准，研究所又建立了"博士后科研工作站"；2008年被上海市学位委员会批准列入"上海研究生联合培养基地"。

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